Antimicrobial susceptibility of Escherichia coli F4, Pasteurella multocida, and Streptococcus suis isolates from a diagnostic veterinary laboratory and recommendations for a surveillance system

Can Vet J. 2014 Apr;55(4):341-8.

Abstract

Antimicrobial susceptibility data on Escherichia coli F4, Pasteurella multocida, and Streptococcus suis isolates from Ontario swine (January 1998 to October 2010) were acquired from a comprehensive diagnostic veterinary laboratory in Ontario, Canada. In relation to the possible development of a surveillance system for antimicrobial resistance, data were assessed for ease of management, completeness, consistency, and applicability for temporal and spatial statistical analyses. Limited farm location data precluded spatial analyses and missing demographic data limited their use as predictors within multivariable statistical models. Changes in the standard panel of antimicrobials used for susceptibility testing reduced the number of antimicrobials available for temporal analyses. Data consistency and quality could improve over time in this and similar diagnostic laboratory settings by encouraging complete reporting with sample submission and by modifying database systems to limit free-text data entry. These changes could make more statistical methods available for disease surveillance and cluster detection.

Sensibilité antimicrobienne des isolats d’Escherichia coliF4, dePasteurella multocidaet deStreptococcus suistransmise par un laboratoire de diagnostic vétérinaire et recommandations pour un système de surveillance. Les données de sensibilité antimicrobienne sur les isolats d’Escherichia coli F4, de Pasteurella multocida et de Streptococcus suis provenant des porcs de l’Ontario (de janvier 1998 à octobre 2010) ont été acquises auprès d’un laboratoire de diagnostic vétérinaire complet situé en Ontario, au Canada. En relation avec la création éventuelle d’un système de surveillance pour l’antibiorésistance, des données ont été évaluées pour déterminer la facilité de gestion, l’intégralité, la cohérence et l’applicabilité des analyses temporelles et spatiales. Des données limitées sur l’emplacement de la ferme empêchaient des analyses spatiales et des données démographiques manquantes limitaient leur utilisation comme prédicteurs au sein de modèles statistiques multivariables. Les changements du groupe standard d’antimicrobiens utilisés pour les tests de sensibilité ont réduit le nombre d’antimicrobiens disponibles pour des analyses temporelles. La cohérence et la qualité des données pourraient être améliorées au fil du temps dans ce laboratoire de diagnostic et d’autres installations semblables en encourageant la production de rapports complets avec la soumission d’échantillons et en modifiant les systèmes des bases de données afin de limiter l’entrée de données en forme libre. Ces changements pourraient rendre d’autres méthodes statistiques disponibles pour la surveillance des maladies et la détection de grappes.(Traduit par Isabelle Vallières).

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Animals
  • Anti-Bacterial Agents / pharmacology*
  • Escherichia coli / classification
  • Escherichia coli / drug effects*
  • Escherichia coli Infections / epidemiology
  • Escherichia coli Infections / microbiology
  • Escherichia coli Infections / veterinary
  • Laboratories
  • Ontario / epidemiology
  • Pasteurella Infections / epidemiology
  • Pasteurella Infections / microbiology
  • Pasteurella Infections / veterinary
  • Pasteurella multocida / drug effects*
  • Population Surveillance
  • Streptococcal Infections / epidemiology
  • Streptococcal Infections / microbiology
  • Streptococcal Infections / veterinary
  • Streptococcus suis / drug effects*
  • Swine
  • Swine Diseases / epidemiology
  • Swine Diseases / microbiology*
  • Veterinary Medicine

Substances

  • Anti-Bacterial Agents