Background: Severe acute respiratory syndrome (SARS) caused the first epidemic of the 21st century and continues to threaten the global community.
Objective: To assess the incidence of coinfection in patients confirmed to have SARS-associated coronavirus (SARS-CoV) infection, and thus, to determine the risk of ruling out SARS by ruling in another diagnosis.
Methods: The present report is a retrospective study evaluating the incidence and impact of laboratory-confirmed SARS-CoV and other pulmonary pathogens in 117 patients. These patients were evaluated in a Toronto, Ontario, community hospital identified as the epicentre for the second SARS outbreak.
Results: Coinfection with other pulmonary pathogens occurred in patients with SARS. Seventy-three per cent of the patient population evaluated had laboratory-confirmed SARS-CoV infection. Serology showing acute or recent Chlamydophila pneumoniae or Mycoplasma pneumoniae infection revealed an incidence of 30% and 9%, respectively, in those with SARS. These rates are similar to previously published studies on coinfection in pneumonia. All nucleic acid diagnostic assays were negative for C pneumoniae and M pneumoniae in respiratory samples from patients with SARS having serological evidence for these atypical pathogens.
Conclusions: Diagnostic assays for well-recognized pulmonary pathogens have limitations, and ruling out SARS-CoV by ruling in another pulmonary pathogen carries significant risk. Despite positive serology for atypical pathogens, in a setting where clinical suspicion for SARS is high, specific tests for SARS should be performed to confirm or exclude a diagnosis.
HISTORIQUE: Le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS) a causé la première épidémie du 21e siècle et continue de représenter une menace globale pour l’être humain.
OBJECTIF: Mesurer l’incidence des co-infections chez les patients avérés infectés par le coronavirus associé au SRAS (SRAS-coV) et déterminer ainsi s’il y a un risque à écarter un diagnostic de SRAS en faveur d’un autre diagnostic.
MÉTHODES: Le présent rapport décrit une étude rétrospective qui visait à évaluer l’incidence et l’impact du SRAS-coV et d’autres pathogènes pulmonaires confirmés en laboratoire chez 117 patients. Ces patients ont été examinés dans un hôpital communautaire de Toronto, en Ontario, identifié comme l’épicentre de la seconde éclosion de SRAS.
RÉSULTATS: La co-infection par d’autres pathogènes pulmonaires a été notée chez des patients victimes du SRAS. Soixante-treize pour cent de la population de patient évalués présentaient une infection à SRAS-coV, analyses de laboratoires à l’appui. Des épreuves sérologiques ont révélé la présence d’infections aiguës ou récentes à Chlamydophila pneumoniæ ou à Mycoplasma pneumoniæ, selon une incidence respective de 30 % et de 9 % chez les sujets atteints de SRAS. Ces taux font écho aux résultats enregistrés lors d’études publiées antérieurement sur la co-infection dans la pneumonie. Tous les tests diagnostiques reposant sur l’amplification génique de l’acide nucléique se sont révélés négatifs à l’égard de C pneumoniæ et de M pneumoniæ dans les spécimens respiratoires provenant de patients atteints de SRAS, alors que les épreuves sérologiques indiquaient la présence de ces pathogènes atypiques.
CONCLUSIONS: Les tests diagnostiques de dépistage des pathogènes respiratoires bien connus ont des limites et le fait d’écarter un diagnostic de SRAS-coV en faveur d’un autre pathogène pulmonaire comporte un risque important. Malgré les tests sérologiques positifs, dans un contexte clinique où on soupçonne fort l’implication du SRAS, des tests spécifiques de dépistage du SRAS doivent être effectués pour confirmer ou infirmer le diagnostic.