Using tuberculosis patient characteristics to predict future cases with matching genotype results

Public Health Action. 2014 Mar 21;4(1):47-52. doi: 10.5588/pha.13.0098.

Abstract

Setting: United States.

Background: It is unknown whether tuberculosis (TB) case or patient characteristics can predict the likelihood of future related TB cases.

Objective: To estimate the likelihood for future related cases, i.e., cases with matching TB genotypes within the same county diagnosed within the 2 years following the year of reporting of each included case.

Design: We considered all TB cases with genotyping results reported in the United States during 2004-2010. Predictive scores were calculated based on patient characteristics by dividing the number of patients who were not the last case in a county-level TB genotype cluster by the total number of patients.

Results: Overall, there was a 30.8% chance that a future related case would be detected during the 2 years following the report year of any given case. Future related cases were detected in 34.7% of instances following the diagnosis of smear-positive cases, 51.9% of instances following the diagnosis of a homeless patient and 45.2% of instances following the diagnosis of a patient who reported substance abuse. Predictive scores ranged by race (White 13.9%, Native Hawaiian 43.8%) and age group (⩾65 years 13.1%, 0-4 years 43%), and were higher for US-born patients.

Conclusions: Behavioral and sociodemographic factors can help predict the likelihood of future related cases and can be used to prioritize contact investigations.

Contexte : Etats-Unis.Cadre : On ne sait pas si les caractéristiques d'un cas de tuberculose (TB) ou du patient permettent de prévoir la probabilité de contamination dans l'avenir.Objectif : Estimer la probabilité de cas présentant un génotype similaire dans le même conté et dans une période de 2 ans suivant le cas index.Schéma : Nous avons étudié tous les cas de TB avec génotypage déclarés aux Etats-Unis entre 2004 et 2010. Les scores prédictifs ont été calculés en fonction des caractéristiques du patient en divisant le nombre de patients qui n'étaient pas le dernier cas d'un groupement de génotypes au niveau d'un conté par le nombre total de patients.Résultats : Le risque global de nouveau cas lié à un autre cas était de 30,8% pendant les 2 années suivant l'année de déclaration de tout nouveau cas. Ces contaminations ont été détectées dans 34,7% des circonstances après diagnostic d'un cas à frottis positif, 51,9%, après diagnostic d'un patient sans domicile fixe et 45,2%, après diagnostic d'un patient toxicomane. Les scores prédictifs variaient en fonction de l'ethnie (Blancs 13,9% ; Amérindiens/Hawaïens 43,8%), l'âge (>65 ans 13,1% ; 0–4 ans 43%) et étaient plus élevé chez les patients nés aux Etats-Unis.Conclusion: Les facteurs comportementaux et socio-démographiques peuvent contribuer à prévoir la probabilité d'infection de cas dans le futur et peuvent servir à prioriser les recherches de sujets contacts.

Marco de referencia: En los Estados Unidos de América se desconoce si las características clínicas de un caso de tuberculosis (TB) o las características del paciente permiten pronosticar la probabilidad de aparición de futuros casos de TB relacionados.Objectivo: Evaluar la probabilidad de aparición en el futuro de casos relacionados — es decir, casos con genotipos equivalentes, diagnosticados en el mismo condado, durante los 2 primeros años después del año de notificación de cada caso incluido.Métodos: Se consideraron en el estudio todos los casos de TB notificados en los Estados Unidos que contaban con resultados de genotipificación entre el 2004 y el 2010. Se calcularon las puntuaciones pronósticas en función de las características del paciente, al dividir el número de pacientes que no fueron el último caso de un conglomerado genotípico de TB a escala del condado, por el número total de pacientes.Resultados: En general, se observó una probabilidad de 30,8% de aparición de un caso relacionado, durante los 2 años que siguieron al año de notificación de cualquier caso dado. Se observaron casos relacionados en el 34,7% de las veces después del diagnóstico de casos con baciloscopia positiva; el 51,9% de las veces después del diagnóstico de una persona sin domicilio; y en el 45,2% de las veces tras el diagnóstico de un paciente que refería consumo de drogas. Las puntuaciones pronósticas oscilaron, con respecto a la etnia, entre 13,9% en la etnia blanca y 43,8% en los nativos de Hawái); con respecto al grupo de edad, entre 13,1% a partir de los 65 años y 43% en el grupo entre 0 años y 4 años; y el índice pronóstico fue más alto en los pacientes nacidos en los Estados Unidos.Conclusión: Los factores comportamentales y sociodemográficos contribuyen a predecir la probabilidad de aparición de casos futuros relacionados con un caso de TB y se pueden utilizar con el propósito de priorizar las investigaciones de contactos.

Keywords: genotype; transmission; tuberculosis.