Isolation and analysis of the molecular epidemiology and zoonotic significance of Mycobacterium tuberculosis in domestic and wildlife ruminants from three states in India

Rev Sci Tech. 2018 Dec;37(3):999-1012. doi: 10.20506/rst.37.3.2902.

Abstract

The majority of tuberculosis cases in ruminants are caused by Mycobacterium bovis (MB). However, in this study, the authors reported the isolation of Mycobacterium tuberculosis (MT) from bovine milk, nasal swabs and post-mortem tissue samples (n = 841) collected from cattle and buffaloes in the states of Telangana, Maharashtra and Gujarat in India in the period from 2010 to 2015. The isolates (n = 7) were confirmed as Mycobacterium due to their growth characteristics and colony morphology in a commercial liquid medium Mycobacterial Growth Indicator Tube (MGIT)™ employing the BD BACTEC™ MGIT™ 960 system and the Löwenstein-Jensen (LJ) medium supplemented with glycerol but not with sodium pyruvate, and BD-DIFCO™ Middlebrook 7H10 agar containing oleic albumin dextrose catalase (OADC). These isolates were initially identified as members of the M. tuberculosis complex (MTC) using a commercial nested polymerase chain reaction (PCR) kit based on the IS6110 MTC specific nucleotide sequence. The isolates were confirmed as MT using three commercial line probe assay kits, were further genotyped, and the spoligotypes identified were of East African Indian (EAI) 3_IND, EAI5, Central-Asian (CAS) 1_DELHI, U and T1 lineages. Two MT isolates from one antelope (Antilope cervipara) andone gazelle (Gazella bennettii) from Gujarat, which were identified previously, were spoligotyped during this study and identified as belonging to EAI3_IND and EAI5 lineages, respectively. The epidemiological significance and zoonotic implications of regional presence and documentation of the same or two differents poligotypes in different species within the family Bovidae as well as humans is discussed.

La majorité des cas de tuberculose chez les ruminants sont dus à Mycobacterium bovis. Néanmoins, les auteurs rapportent les résultats d’une étude réalisée de 2010 à 2015 en Inde (états de Telangana, Maharashtra et Gujarat), au cours de laquelle Mycobacterium tuberculosis a été isolé à partir de lait de vache ainsi que d’écouvillons nasaux et de prélèvements tissulaires postmortem (n = 841) collectés sur des bovins et des buffles. L’appartenance des isolats au genre Mycobacterium a été confirmée par l’observation des caractéristiques de croissance des colonies et de leur morphologie dans un milieu de culture liquide du commerce (Mycobacterial Growth Indicator Tube [MGIT]™ : tube avec indicateur de croissance mycobactérienne) en utilisant l’automate BD BACTEC™MGIT™ 960 et un milieu de Lowenstein-Jensen additionné de glycérol mais sanspyruvate de sodium, ainsi qu’une gélose BD-DIFCO™ Middlebrook enrichie en acide oléique, albumine, dextrose et catalase (OADC). Dans un premier temps, les isolats ont été identifiés comme étant des membres du complexe M. tuberculosisau moyen d’une amplification en chaîne par polymérase nichée ciblant la séquence nucléotidique spécifique IS6110 du complexe M. tuberculosis. Trois kits commerciaux d’analyse de souches ont permis d’identifier les isolats comme étant M. tuberculosis ; il a ensuite été procédé à l’analyse des génotypes des souches de spoligotypes, lesquelles appartenaient aux lignées East African Indian (EAI) 3_IND,EAI5, Central-Asian (CAS) 1_DELHI, U et T1. Les spoligotypes de deux isolats de M. tuberculosis obtenus précédemment, provenant respectivement d’une antilope(Antilope cervipara) et d’une gazelle (Gazella bennettii) de l’état de Gujarat ont été analysés lors de la présente étude et identifiés comme étant respectivement de lignée EAI3_IND et EAI5. Les auteurs analysent l’importance épidémiologique et la portée zoonotique de la présence rapportée dans la région du même spoligotype ou de deux spoligotypes différents chez des espèces différentes de la famille des Bovidés ainsi que chez l’homme.

La mayoría de los casos de tuberculosis que afectan a los rumiantes son causados por Mycobacterium bovis (MB). En este estudio, sin embargo, los autores dan cuenta del aislamiento de Mycobacterium tuberculosis (MT) en muestras de leche, frotis nasales y tejidos obtenidos post-mortem (n = 841) de ganado vacuno y búfalos de los estados de Telangana, Maharashtra y Gujarat (India) entre 2010 y 2015. Se confirmó que los microorganismos aislados(n = 7) eran micobacterias por sus características de crecimiento y la morfología de las colonias cultivadas en medio líquido comercial Mycobacterial Growth Indicator Tube (MGIT)™ empleando el sistema BD BACTEC™ MGIT™ 960 y el medio Löwenstein-Jensen (LJ) suplementado con glicerol, pero no con piruvato sódico, y agar BD-DIFCO™ Middlebrook 7H10 con ácido oleico, albúmina, dextrosa y catalasa (OADC). Mediante una PCR (reacción en cadena de la polimerasa) anidada comercial basada en la secuencia nucleotídica IS6110 específica del complejo, se empezó por determinar que esos microorganismos pertenecían al complejo M. tuberculosis (MTC). Tras confirmar que se trataba de M. tuberculosis empleando tres ensayos comerciales con sondas en línea, se procedió a caracterizar su genotipo, lo que sirvió para identificar espoligotipos correspondientes a los siguientes linajes: East African Indian (EAI) 3_IND, EAI5, Central-Asian (CAS) 1_DELHI, U y T1. Durante el estudio se caracterizaron asimismo los espoligotipos de dos M. tuberculosis aislados previamente a partir de un antílope (Antilope cervipara) y una gacela (Gazella bennettii) de Gujarat, lo que permitió adscribirlos respectivamente a los linajes EAI3_IND y EAI5. Los autores exponen la importancia desde el punto de vista epidemiológico que tiene la presencia comprobada en la región del mismo espoligotipo o de dos espoligotipos diferentes en distintas especies de la familia Bovidae, así como en el ser humano, y las consecuencias que de ahí se siguen por lo que respecta a posibles zoonosis.

Keywords: Epidemiology; India; Isolation; Mycobacterium tuberculosis; Ruminant; Spoligotyping; Zoonosis.

MeSH terms

  • Animals
  • Cattle
  • Humans
  • India
  • Molecular Epidemiology
  • Mycobacterium bovis
  • Mycobacterium tuberculosis*
  • Ruminants
  • Tuberculosis* / veterinary