Flood Season Microbiota from the Amazon Basin Lakes: Analysis with Metagenome Sequencing

Célio Dias Santos Júnior; Danyelle Toyama; Tereza Cristina Souza de Oliveira; Fernando Pellon de Miranda; Flávio Henrique-Silva

doi:10.1128/MRA.00229-19

Flood Season Microbiota from the Amazon Basin Lakes: Analysis with Metagenome Sequencing

Microbiol Resour Announc. 2019 Apr 25;8(17):e00229-19. doi: 10.1128/MRA.00229-19.

Authors

Célio Dias Santos Júnior¹, Danyelle Toyama¹, Tereza Cristina Souza de Oliveira², Fernando Pellon de Miranda³, Flávio Henrique-Silva⁴

Affiliations

¹ Laboratório de Biologia Molecular, Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, São Paulo, Brazil.
² Departamento de Química, Universidade Federal do Amazonas, Manaus, Amazonas, Brazil.
³ Centro de Pesquisas e Desenvolvimento Leopoldo Américo Miguez de Mello, Petróleo Brasileiro S.A. (Petrobras), Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil.
⁴ Laboratório de Biologia Molecular, Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos, São Paulo, Brazil dfhs@ufscar.br.

Abstract

Despite an apparent geographic separation of the Amazon water bodies, they are an interconnected system. During floods, the microbiota of rivers, lakes, and soil combines. This study used metagenomics sequencing to survey the microbiota of the Amazon Basin lakes during flood season, showing important patterns in microbial communities.