Introduction: Mycobacterium tuberculosis is the cause of pulmonary and extra-pulmonary tuberculosis. Latent tuberculosis is asymptomatic and the results of mycobacterial culture in this case are negative. The purpose of this study was to determine the prevalence of M. tuberculosis in negative cultures of pulmonary and extra-pulmonary samples from suspected tuberculosis patients in Yazd city. Methods: Specimens were collected from 44 patients with suspected pulmonary and extra-pulmonary tuberculosis. The culture result of all samples was negative and DNA was extracted from culture-negative samples. Then the IS6110 sequence of M. tuberculosis was determined by PCR, and the presence of 16S rRNA and rrnA-PCL1 was checked by real-time PCR. Data were analyzed using SPSS software. Results: Of the 44 pulmonary and extra-pulmonary samples, M. tuberculosis DNA was detected in 12 cases (27%) by PCR. Of the 12 positive cases of M. tuberculosis, 9 were detected in lung samples and 3 in extra-pulmonary samples. For rrnA-PCL1 and 16S rRNA genes, 10 samples (23%) were confirmed positive by real-time PCR. The frequency distributions of M. tuberculosis according to PCR and real-time PCR were not significantly different (p=0.403). Conclusion: Latent tuberculosis is characterized by the absence of clinical symptoms and the absence of bacilli in the culture. Regardless of the statistical analysis of results, PCR more effectively detects M. tuberculosis than does real-time PCR. According to the results, detection of M. tuberculosis in pulmonary and extra-pulmonary samples with culture-negative by PCR is reliable.
Einleitung: Mycobacterium tuberculosis ist die Ursache der pulmonalen und extra-pulmonalen Tuberkulose. Die latente Tuberkulose verläuft asymptomatisch und die Ergebnisse der mykobakteriellen Kultur sind unter diesen Bedingungen negativ. In der Studie sollte die Prävalenz von M. tuberculosis bei negativem Kulturergebnis pulmonaler und extra-pulmonaler Proben von Patienten mit Verdacht auf Tuberkulose in der Stadt Yazd bestimmt werden.Methoden: Bei 44 Patienten mit Verdacht auf pulmonale und extra-pulmonale Tuberkulose wurden Proben entnommen. Das Kulturergebnis aller Stichproben war negativ und DNA wurde aus Kultur-negativen Stichproben extrahiert. Dann wurde die IS6110-Sequenz von M. tuberculosis durch PCR nachgewiesen und das Vorhandensein von 16S rRNA und rrnA-PCL1 durch real-time PCR überprüft. Die Daten wurden mit SPSS-Software analysiert.Ergebnisse: Von 44 pulmonalen und extra-pulmonalen Proben wurde M. tuberculosis-DNA in 12 Fällen (27%) mittels PCR nachgewiesen. Von den 12 positiven Fällen wurden 9 in pulmonalen und 3 in extra-pulmonalem Material nachgewiesen. Für rrnA-PCL1- und 16S rRNA-Gene wurden 10 Proben (23%) durch real-time PCR positiv bestätigt. Der p-Wert für die Häufigkeitsverteilung von M. tuberculosis durch PCR und real-time PCR wurde mit 0,403 bestimmt.Schlussfolgerung: Die latente Tuberkulose ist gekennzeichnet durch Fehlen klinischer Symptome und Abwesenheit von Bakterien in der Kultur. Unabhängig von der statistischen Analyse der Ergebnisse ist die PCR zum Nachweis von M. tuberculosis effektiver als real-time PCR und zum Nachweis von M. tuberculosis in pulmonalen und extra-pulmonalen Proben bei negativer Kultur geeignet.
Keywords: Mycobacterium tuberculosis; PCR; latent tuberculosis; real-time PCR; rrnA-PCL1.