Pattern of bacterial profile and antibiotic susceptibility among neonatal sepsis cases at Cairo University Children Hospital

J Taibah Univ Med Sci. 2020 Feb 4;15(1):39-47. doi: 10.1016/j.jtumed.2019.12.005. eCollection 2020 Feb.

Abstract

Objectives: Neonatal sepsis is the third leading contributor to mortality and morbidity. Emanating resistance to antibiotics in neonatal intensive care units (NICUs) is considered a major burden. In this study, we aimed to investigate the bacterial prevalence and antibiotic profile among patients admitted with sepsis in the NICU of Cairo University Children Hospital.

Methods: Neonates with suspected sepsis were evaluated for bacterial sepsis in their blood cultures. The neonates with positive bacterial blood culture were included in this study, whereas neonates with negative culture were excluded. Positive samples were sub-cultured on blood, MacConkey, and chocolate agar plates. Organisms were identified by Gram staining and biochemical reactions. Antibiotic susceptibility was assessed by the Kirby-Bauer disc diffusion method.

Results: Seventy blood cultures (31.7%) were bacteria-positive: 45.3% for Klebsiella, 22.7% for coagulase-negative staphylococci (CoNS), and for Acinetobacter (10.7%), methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) (9.3%), Pseudomonas (5.3%), Enterobacter (4%), and streptococci (2.7%). High resistance to all cephalosporins, B-lactamase combinations, penicillin, carbapenems, and aminoglycosides was observed. All Gram-negative Enterobacteria showed the highest sensitivity to levofloxacin, whereas Pseudomonas and Acinetobacter were highly sensitive to polymyxin B. Gram-positive samples were sensitive to vancomycin and linezolid. Streptococci were slightly sensitive to vancomycin and highly sensitive to macrolides and cefotaxime.

Conclusions: In our study, Klebsiella and CoNS were the most common isolates in neonatal sepsis. The levels of multidrug-resistant strains were alarmingly high. This finding negatively affected the outcomes, prompting the need for a strict guideline for antibiotics use.

أهداف البحث: يعتبر إنتان الدم الوليدي السبب الرئيس الثالث لمرض ووفاة الأطفال في وحدات الرعاية المركزة لحديثي الولادة. تعتبر مقاومة البكتيريا للمضادات الحيوية في وحدة العناية المركزة لحديثي الولادة عبئا كبيرا. في هذه الدراسة، استهدفنا دراسة مدى انتشار البكتيريا وكذلك المضادات الحيوية المستخدمة بين المرضى الذين تم قبولهم بالإنتان، خلال العام ٢٠١٧، في وحدة العناية المركزة لحديثي الولادة في مستشفيات الأطفال بجامعة القاهرة، التي تضم ٥٠ حاضنة.

طرق البحث: تم تقييم حديثي الولادة مع اشتباه إنتان الدم عن طريق مزرعة الدم. تم تحديد التضمين في الدراسة عن طريق مزرعة الدم البكتيرية الإيجابية، في حين تم استبعاد حالات الزراعة السلبية. كما تمت زراعة العينات الإيجابية باستخدام الزراعة الفرعية على آغارات الدم، وآغار ماكونكي، وآغار الشوكولاتة. تم تحديد البكتيريا عن طريق صبغة غرام وردود الفعل الكيميائية الحيوية. وتم إجراء الحساسية للمضادات الحيوية بطريقة نشر قرص كيربي باور.

النتائج: وجدت سبعون مزرعة دم إيجابية (٣١.٧٪): ٤٥.٣٪ لكليبسيلة، و٢٢.٧٪ للمكورات العنقودية سالبة الكواجيولاز، تليها البكتيريا الراكدة، والمكورات العنقودية الذهبية المقاومة للميثيسيلين، والبكتيريا الزائفة، والمكورات العنقودية الذهبية، والأمعائية والبكتيريا العقدية. ولوحظت مقاومة عالية لجميع السيفالوسبورينات، ومجموعات البيتا-لاكتاماز، والبنسلين، والكاربابينيمات، والأمينوغليكوزيدات. أظهرت جميع بكتيريا الأمعائية سلبية الغرام أعلى حساسية لليفوفلوكساسين، في حين أن البكتيريا الزائفة والبكتيريا الراكدة كانتا شديدة الحساسية لبولي ميكسين ب. في حين استجابت البكتيريا الموجبة الجرام لمضاد الڤانكومايسين واللينوزوليد. وكانت العقدية أقل حساسية للڤانكومايسين، ولكنها استجابت للغاية للماكروليدات وسيفوتاكسيم.

الاستنتاجات: توصلت الدراسة إلى أن ميكروبي الكليبسيلة والمكورات العنقودية سالبة الكواجيولاز هما أكثر الميكروبات تواجدا بمزارع الدم، وأن مقاومة الميكروبات للمضادات الحيوية قد وصلت إلى مستويات تنذر بالخطر وتشكل خطرا داهما على حياة هؤلاء الأطفال مما يستدعى التخطيط الدقيق لتنظيم استعمال المضادات الحيوية.

Keywords: Antibiotic resistance; Antibiotic sensitivity; Bacterial prevalence; Neonatal sepsis.