[Molecular diagnosis of COVID-19 – present experiences]

Postepy Biochem. 2021 Jan 5;66(4):316-322. doi: 10.18388/pb.2020_363. Print 2020 Dec 31.
[Article in Polish]

Abstract

Severe acute respiratory syndrome Coronavirus-2 (SARS-CoV-2), a new highly emerging and pathogenic for human RNA virus, is responsible for the present COVID-19 pandemic. Molecular diagnostic methods, including real-time reverse transcription-PCR (RT-PCR) assay are the recommended methods for the identification and laboratory confirmation of COVID-19 cases. RT-PCR allows for detection the RNA of the virus in clinical specimens from patients suspected of COVID-19 with high specificity and sensitivity. Testing is still crucial for rapid detection of infected persons, implementation of appropriate measures to suppress further virus transmission and mitigate its impact. In response to demand of a molecular diagnostic test for SARS-CoV-2, within a first few months ongoing pandemic many commercial kits has become available on the market. However, these tests have varied in number and type of molecular targets, time of reaction as well as quality. In this study we compared different commercial tests for the detection of SARS-CoV-2 in clinical samples sending to Laboratory of Department of Virology, NIPH-NIH.

Koronawirus SARS-CoV-2 odpowiedzialny jest za wystąpienie światowej pandemii choroby COVID-19, w czasie której powstała konieczność przeprowadzania bardzo dużej liczby badań na obecność tego wirusa przez laboratoria diagnostyczne. Podstawową, rekomendowaną przez WHO metodą pozwalającą na laboratoryjne potwierdzenia zakażenia wirusem SARS-CoV-2 są metody biologii molekularnej, w tym technika real-time PCR z etapem odwrotnej transkrypcji. Pozwalają one na wykrycie RNA wirusa w próbkach od osób spełniających kryteria definicji podejrzenia przypadku lub z kontaktu. Wiąże się to z ogromnym zapotrzebowaniem na odpowiednie, komercyjne testy diagnostyczne. Odpowiedzią na to zapotrzebowanie było pojawienie się na światowym rynku szeregu testów molekularnych. Testy te różnią się m.in. liczbą i rodzajem wykrywanych genów, zastosowanymi barwnikami. W pracy przedstawiono wyniki sprawdzenia różnych komercyjnych testów diagnostycznych przeprowadzonego w Laboratorium Zakładu Wirusologii NIZP-PZH w ramach dobrej praktyki laboratoryjnej.

MeSH terms

  • COVID-19 Testing
  • COVID-19* / diagnosis
  • Humans
  • SARS-CoV-2