[Quarantine nematode species and pathotypes potentially dangerous for domestic potato production: populations diversity and the genetics of potato resistance]

Vavilovskii Zhurnal Genet Selektsii. 2020 Nov;24(7):705-721. doi: 10.18699/VJ20.665.
[Article in Russian]

Abstract

The review considers quarantine species and nematode pathotypes potentially dangerous for domestic potato production. Potatoes are affected by more than 30 types of parasitic nematodes, but the review focuses on the most harmful representatives of genera that cause great damage to potato production: Globodera, Ditylenchus, Nacobbus and Meloidogyne. Phytopathological and molecular methods of identification of species and pathotypes and the main achievements in studying the population variability of parasitic potato nematodes were analyzed. It was shown that due to the peculiarities of the life cycle of nematodes and lability of their genomes, the genetic variability of these organisms is very high, which creates a threat of forming new pathogenic genotypes of the parasites. The information about the intra- and interpopulation variability of nematodes is important for studying the ways of introduction and distribution of separate species, as well as for searching for the correlations of molecular markers with the pathotype. Phylogenetic studies based on modern data on genetic variability of populations have allowed to reveal species complexes in Globodera pallida (Stone) Behrens and Nacobbus aberrans (Thorne) Thorne & Allen (sensu lato), including cryptic species. The main components of successful protection preventing a wide distribution of parasitic nematodes are quarantine measures, agricultural techniques, biological methods of protection and cultivation of resistant cultivars. Special attention in the review is paid to the breeding of potato cultivars with durable resistance to various nematode pathotypes, because the cultivation of such varieties is the most ecologically safe and economically advantageous way to prevent epiphytoties. Currently, significant progress has been made in the genetic protection of potato cultivars, especially against cyst-forming nematodes. The review provides data on sources of potato resistance to parasitic nematodes identified in collections of wild and cultivated species. Data on identified R-gens and QTL of resistance that have been introduced into breeding varieties using different methods and approaches are analyzed. The literature data on the study of structural and functional organization of genes for resistance to potato cyst nematodes are given. The results of molecular research on revealing the polymorphisms of loci involved in the control of resistance to cyst and gall nematodes, the development of molecular markers of certain genes and their use in marker-assisted selection for developing of new resistant cultivars, including those with group resistance, are considered.

Обзор посвящен проблеме потенциально опасных для отечественного картофелеводства каран- тинных видов и патотипов нематод. Картофель поражают более 30 видов паразитических нематод, однако в статье основное внимание уделено самым вредоносным, приносящим большой ущерб картофелеводству пред- ставителям родов Globodera, Ditylenchus, Nacobbus и Meloidogyne. Проанализированы фитопатологические и молекулярные методы идентификации видов и патотипов и основные достижения в изучении изменчивости популяций паразитических нематод картофеля. Показано, что, благодаря особенностям жизненного цикла не- матод и лабильности их геномов, генетическая изменчивость этих организмов очень велика, что создает угрозу образования новых патогенных генотипов паразита. Сведения о внутри- и межпопуляционной изменчивости нематод важны для изучения путей интродукции и распространения отдельных видов, а также поиска корреля- ций молекулярных маркеров с определенным патотипом. Филогенетические исследования, основанные на со- временных данных по генетической изменчивости популяций, позволили выявить комплексы видов у Globodera pallida (Stone) Behrens и Nacobbus aberrans (Thorne) Thorne & Allen (sensu lato), включающие криптические виды. К основным составляющим успешной защиты, предотвращающей массовое распространение паразитических нематод, относятся карантинные мероприятия, агротехнические приемы, биологические способы защиты и возделывание устойчивых сортов. Особое внимание в обзоре уделено вопросам селекции сортов картофеля с длительной устойчивостью к различным видам нематод, поскольку возделывание таких сортов – экологически наиболее безопасный и экономически выгодный способ предотвращения эпифитотий. В настоящее время до- стигнуты значительные успехи в генетической защите сортов картофеля, особенно в отношении цистообразую- щих нематод. Приведены сведения об источниках устойчивости картофеля к паразитическим нематодам, выде- ленных в коллекциях диких и культурных видов. Проанализированы данные об идентифицированных R-генах и QTL устойчивости, которые были интрогрессированы в селекционный материал с помощью различных методов и подходов. Представлены результаты изучения структурной и функциональной организации генов устойчиво- сти к цистообразующим нематодам картофеля. Рассмотрены результаты исследований по использованию моле- кулярных маркеров определенных генов в маркер-опосредованной селекции для создания новых устойчивых сортов, в том числе с групповой устойчивостью.

Keywords: Ditylenchus; Globodera; Meloidogyne; Nacobbus; QTL; parasitic nematodes; pathotypes; population variability; potato; resistance cultivars; resistance genes.

Publication types

  • English Abstract