Enterocytozoon bieneusi is an obligate intracellular parasitic fungi that infects a wide range of mammalian hosts. However, the literature is lacking information regarding the presence and diversity of E. bieneusi genotypes in domesticated dogs in Northwestern China. Fecal samples from 604 pet dogs were obtained in 5 cities (Urumqi, Korla, Hotan, Aksu, and Shihezi) in Xinjiang. Screening for E. bieneusi was performed, and isolates were genotyped via nested-PCR amplification of the internal transcribed spacer (ITS) of nuclear ribosomal DNA. The infection rate of E. bieneusi was 6.3% (38/604). The prevalence of E. bieneusi infections in adult animals (>1 year, 10.3%, 15/145) was higher than that in younger (≤1 year) dogs (5.0%, 23/459), which was statistically significant (p = 0.021). No significant difference was observed between the different collection sites or between sexes. Eight distinct genotypes were identified, including 5 known genotypes (PtEb IX, EbpC, D, CD9, and Type IV) and 3 novel genotypes (CD11, CD12, CD13). The most prevalent was genotype PtEb IX, being observed in 50.0% (19/38) of the samples, followed by EbpC (31.6%, 12/38), D (5.3%, 2/38), and the remaining genotypes (CD9, Type IV, CD11, CD12, and CD13) were observed in 1 sample (2.6%, 1/38) each. These findings suggest that genotypes PtEb IX and CD9 are canine host-adapted, and likely pose little risk of zoonotic transmission. Moreover, known zoonotic genotypes EbpC, D, and Type IV represent a public health concern and should undergo further molecular epidemiological investigation.
Title: Détection moléculaire et génotypage d’Enterocytozoon bieneusi chez les chiens de compagnie au Xinjiang, nord-ouest de la Chine.
Abstract: Enterocytozoon bieneusi est un champignon intracellulaire, parasite obligatoire, qui infecte un large éventail d’hôtes mammifères. Cependant, la littérature manque d’informations concernant la présence et la diversité des génotypes d’E. bieneusi chez les chiens domestiques dans le nord-ouest de la Chine. Des échantillons fécaux de 604 chiens de compagnie ont été obtenus dans 5 villes (Urumqi, Korla, Hotan, Aksu et Shihezi) au Xinjiang. Le dépistage d’E. bieneusi a été effectué et les isolats ont été génotypés par amplification PCR nichée de l’espaceur transcrit interne (ITS) de l’ADN ribosomique nucléaire. Le taux d’infection d’E. bieneusi était de 6,3 % (38/604). La prévalence des infections à E. bieneusi chez l’adulte (> 1 an, 10,3 %, 15/145) était plus élevée que chez les chiens plus jeunes (≤ 1 an) (5,0 %, 23/459), ce qui était statistiquement significatif (p = 0,021). Aucune différence significative n’a été observée entre les différents sites de collecte ou entre les sexes. Huit génotypes distincts ont été identifiés, dont 5 connus (PtEb IX, EbpC, D, CD9, Type IV) et 3 nouveaux (CD11, CD12, CD13). Le plus répandu était le génotype PtEb IX, observé dans 50,0 % (19/38) des échantillons, suivi par EbpC (31,6 %, 12/38), D (5,3 %, 2/38) et les génotypes restants (CD9, Type IV, CD11, CD12 et CD13) ont été observés dans 1 échantillon (2,6 %, 1/38) chacun. Ces résultats suggèrent que les génotypes PtEb IX et CD9 sont adaptés à l’hôte canin et présentent probablement un faible risque de transmission zoonotique. De plus, les génotypes zoonotiques connus EbpC, D et Type IV représentent un problème de santé publique et nécessitent une enquête épidémiologique moléculaire plus approfondie.
Keywords: Enterocytozoon bieneusi; Genotype; Infection rate; Pet dogs.
© Y. Cao et al., published by EDP Sciences, 2021.