Predictive marker (re-)analysis of tumor material can be a real obstacle in several tumor entities, like non-small cell lung cancer (NSCLC), due to difficult anatomic conditions and small biopsy samples. As reported in the literature, cytological samples comprise excellent starting material for predictive marker analysis like fluorescence in situ hybridization and next generation sequencing. As for formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples, rigorous quality control and standardized laboratory operating procedures are mandatory. Further advantages of cytological specimens are the rapid and straightforward inspection of representativeness, for example by rapid on-site evaluation (ROSE). Another striking advantage is that the fresh cellular material from smears and serous cavity fluids can be used for the generation of two- and three-dimensional cell culture models. Hereby, in addition to the conventional biomarker testing, complex complementary functional genomic assays can also be applied, for example, to assess the effects of multiple variants in one sample and unknown variants of tumor driver genes and tumor suppressor genes. This information may provide additional vulnerabilities of the tumor to be considered for the therapy decision, for example in the molecular tumor board.
In unterschiedlichen Tumorentitäten, wie beispielsweise dem nicht-kleinzelligen Lungenkarzinom (NSCLC), ist die (wiederholte) Gewinnung von Proben zur Diagnose und zur Untersuchung von prädiktiven Markern aufgrund der anatomischen Verhältnisse in manchen Fällen schwierig. Hier werden häufig sehr kleine oder ausschließlich zytologische Proben gewonnen. Wie bereits gezeigt wurde, lassen sich zytologische Proben exzellent für die prädiktive Markeranalytik mittels Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung und Next Generation Sequencing einsetzen. Auch beim zytologischen Probenmaterial ist wie beim formalinfixierten, paraffineingebetteten Gewebe eine strikte Qualitätskontrolle sowie eine Standardisierung der Laborprozesse von großer Bedeutung. Weitere Vorteile der zytologischen Proben sind die einfache und schnelle Überprüfung der Repräsentativität, zum Beispiel im Rahmen einer Rapid-on-site-Evaluation (ROSE) sowie die Möglichkeit zur Anfertigung von zwei- oder dreidimensionalen präklinischen Zellkulturmodellen. Somit kann das zytologische Probenmaterial in Ergänzung zur prädiktiven Markeranalytik direkt für funktionelle genomische Testungen, z. B. bei unklaren Variantenkonstellationen, expandiert werden. Hieraus können beispielsweise ergänzende Informationen für die Therapieentscheidung gewonnen werden, welche im molekularen Tumorboard in Zukunft hilfreich sein können.
Keywords: Cytopathology; Functional testing; Molecular pathology; Molecular tumor board; Predictive markers.
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