Metagenomics of Kamchatkan hot spring filaments reveal two new major (hyper)thermophilic lineages related to Thaumarchaeota

Res Microbiol. 2013 Jun;164(5):425-38. doi: 10.1016/j.resmic.2013.02.006. Epub 2013 Mar 5.

Abstract

Based on phylogenetic analyses and gene distribution patterns of a few complete genomes, a new distinct phylum within the Archaea, the Thaumarchaeota, has recently been proposed. Here we present analyses of six archaeal fosmid sequences derived from a microbial hot spring community in Kamchatka. The phylogenetic analysis of informational components (ribosomal RNAs and proteins) reveals two major (hyper-)thermophilic clades ("Hot Thaumarchaeota-related Clade" 1 and 2, HTC1 and HTC2) related to Thaumarchaeota, representing either deep branches of this phylum or a new archaeal phylum and provides information regarding the ancient evolution of Archaea and their evolutionary links with Eukaryotes.

Publication types

  • Research Support, Non-U.S. Gov't

MeSH terms

  • Archaea / classification*
  • Archaea / genetics
  • Archaea / isolation & purification*
  • Biota*
  • Cluster Analysis
  • Hot Springs / microbiology*
  • Metagenome*
  • Molecular Sequence Data
  • Phylogeny
  • Russia
  • Sequence Analysis, DNA

Associated data

  • GENBANK/HE574566
  • GENBANK/HE574567
  • GENBANK/HE574568
  • GENBANK/HE574569
  • GENBANK/HE574570
  • GENBANK/HE574571
  • GENBANK/JF305824
  • GENBANK/JF305825
  • GENBANK/JF305826
  • GENBANK/JF305827
  • GENBANK/JF305828
  • GENBANK/JF305829
  • GENBANK/JF305830
  • GENBANK/JF305831
  • GENBANK/JF305832
  • GENBANK/JF305833
  • GENBANK/JF305834
  • GENBANK/JF305835
  • GENBANK/JF305836
  • GENBANK/JF305837
  • GENBANK/JF305838
  • GENBANK/JF305839
  • GENBANK/JF305840
  • GENBANK/JF305841
  • GENBANK/JF305842
  • GENBANK/JF305843
  • GENBANK/JF305844
  • GENBANK/JF305845
  • GENBANK/JF305846
  • GENBANK/JF305847
  • GENBANK/JF305848
  • GENBANK/JF305849
  • GENBANK/JF305850
  • GENBANK/JF305851
  • GENBANK/JF305852
  • GENBANK/JF305853
  • GENBANK/JF305854
  • GENBANK/JF305855
  • GENBANK/JF305856
  • GENBANK/JF305857
  • GENBANK/JF305858
  • GENBANK/JF305859
  • GENBANK/JF305860
  • GENBANK/JF305861
  • GENBANK/JF305862
  • GENBANK/JF305863
  • GENBANK/JF305864
  • GENBANK/JF305865
  • GENBANK/JF305866
  • GENBANK/JF305867
  • GENBANK/JF305868
  • GENBANK/JF305869
  • GENBANK/JF305870
  • GENBANK/JF305871
  • GENBANK/JF305872
  • GENBANK/JF305873
  • GENBANK/JF305874
  • GENBANK/JF305875
  • GENBANK/JF305876
  • GENBANK/JF305877
  • GENBANK/JF305878
  • GENBANK/JF305879
  • GENBANK/JF305880
  • GENBANK/JF305881
  • GENBANK/JF305882
  • GENBANK/JF305883
  • GENBANK/JF305884
  • GENBANK/JF305885
  • GENBANK/JF305886
  • GENBANK/JF305887
  • GENBANK/JF305888
  • GENBANK/JF305889
  • GENBANK/JF305890
  • GENBANK/JF305891
  • GENBANK/JF305892
  • GENBANK/JF305893
  • GENBANK/JF305894
  • GENBANK/JF305895
  • GENBANK/JF305896
  • GENBANK/JF305897
  • GENBANK/JF305898
  • GENBANK/JF305899
  • GENBANK/JF305900
  • GENBANK/JF305901
  • GENBANK/JF305902
  • GENBANK/JF305903
  • GENBANK/JF305904
  • GENBANK/JF305905
  • GENBANK/JF305906
  • GENBANK/JF305907
  • GENBANK/JF305908
  • GENBANK/JF305909
  • GENBANK/JF305910
  • GENBANK/JF305911
  • GENBANK/JF305912
  • GENBANK/JF305913
  • GENBANK/JF305914
  • GENBANK/JF305915
  • GENBANK/JF305916
  • GENBANK/JF305917
  • GENBANK/JF305918
  • GENBANK/JF305919
  • GENBANK/JF305920
  • GENBANK/JF305921
  • GENBANK/JF305922
  • GENBANK/JF305923
  • GENBANK/JF305924
  • GENBANK/JF305925
  • GENBANK/JF305926
  • GENBANK/JF305927
  • GENBANK/JF305928
  • GENBANK/JF305929
  • GENBANK/JF305930
  • GENBANK/JF305931
  • GENBANK/JF305932
  • GENBANK/JF305933
  • GENBANK/JF305934
  • GENBANK/JF305935
  • GENBANK/JF305936
  • GENBANK/JF305937
  • GENBANK/JF305938
  • GENBANK/JF305939
  • GENBANK/JF305940
  • GENBANK/JF305941
  • GENBANK/JF305942
  • GENBANK/JF305943
  • GENBANK/JF305944
  • GENBANK/JF305945
  • GENBANK/JF305946
  • GENBANK/JF305947
  • GENBANK/JF305948
  • GENBANK/JF305949
  • GENBANK/JF305950
  • GENBANK/JF305951
  • GENBANK/JF305952
  • GENBANK/JF305953
  • GENBANK/JF305954
  • GENBANK/JF305955
  • GENBANK/JF305956
  • GENBANK/JF305957
  • GENBANK/JF305958
  • GENBANK/JF305959
  • GENBANK/JF305960
  • GENBANK/JF305961
  • GENBANK/JF305962
  • GENBANK/JF305963
  • GENBANK/JF305964
  • GENBANK/JF305965
  • GENBANK/JF305966
  • GENBANK/JF305967
  • GENBANK/JF305968
  • GENBANK/JF305969
  • GENBANK/JF305970
  • GENBANK/JF305971
  • GENBANK/JF305972
  • GENBANK/JF317811
  • GENBANK/JF317812
  • GENBANK/JF317813
  • GENBANK/JF317814
  • GENBANK/JF317815
  • GENBANK/JF317816
  • GENBANK/JF317817
  • GENBANK/JF317818
  • GENBANK/JF317819
  • GENBANK/JF317820
  • GENBANK/JF317821
  • GENBANK/JF317822
  • GENBANK/JF317823
  • GENBANK/JF317824
  • GENBANK/JF317825
  • GENBANK/JF317826
  • GENBANK/JF317827
  • GENBANK/JF317828
  • GENBANK/JF317829
  • GENBANK/JF317830
  • GENBANK/JF317831
  • GENBANK/JF317832
  • GENBANK/JF317833
  • GENBANK/JF317834
  • GENBANK/JF317835
  • GENBANK/JF317836
  • GENBANK/JF317837
  • GENBANK/JF317838
  • GENBANK/JF317839
  • GENBANK/JF317840
  • GENBANK/JF317841
  • GENBANK/JF317842
  • GENBANK/JF317843
  • GENBANK/JF317844
  • GENBANK/JF317845
  • GENBANK/JF317846
  • GENBANK/JF317847
  • GENBANK/JF317848
  • GENBANK/JF317849
  • GENBANK/JF317850
  • GENBANK/JF317851
  • GENBANK/JF317852
  • GENBANK/JF317853
  • GENBANK/JF317854
  • GENBANK/JF317855
  • GENBANK/JF317856
  • GENBANK/JF317857
  • GENBANK/JF317858
  • GENBANK/JF317859
  • GENBANK/JF317860
  • GENBANK/JF317861
  • GENBANK/JF317862
  • GENBANK/JF317863
  • GENBANK/JF317864
  • GENBANK/JF317865
  • GENBANK/JF317866
  • GENBANK/JF317867
  • GENBANK/JF317868
  • GENBANK/JF317869
  • GENBANK/JF317870
  • GENBANK/JF317871
  • GENBANK/JF317872
  • GENBANK/JF317873
  • GENBANK/JF317874
  • GENBANK/JF317875
  • GENBANK/JF317876
  • GENBANK/JF317877
  • GENBANK/JF317878
  • GENBANK/JF317879
  • GENBANK/JF317880
  • GENBANK/JF317881
  • GENBANK/JF317882
  • GENBANK/JF317883
  • GENBANK/JF317884
  • GENBANK/JF317885
  • GENBANK/JF317886
  • GENBANK/JF317887
  • GENBANK/JF317888
  • GENBANK/JF317889
  • GENBANK/JF317890
  • GENBANK/JF317891
  • GENBANK/JF317892
  • GENBANK/JF317893
  • GENBANK/JF317894
  • GENBANK/JF317895
  • GENBANK/JF317896
  • GENBANK/JF317897
  • GENBANK/JF317898
  • GENBANK/JF317899
  • GENBANK/JF317900
  • GENBANK/JF317901
  • GENBANK/JF317902
  • GENBANK/JF317903
  • GENBANK/JF317904
  • GENBANK/JF317905
  • GENBANK/JF317906
  • GENBANK/JF317907
  • GENBANK/JF317908
  • GENBANK/JF317909
  • GENBANK/JF317910
  • GENBANK/JF317911
  • GENBANK/JF317912
  • GENBANK/JF317913
  • GENBANK/JF317914
  • GENBANK/JF317915
  • GENBANK/JF317916
  • GENBANK/JF317917
  • GENBANK/JF317918
  • GENBANK/JF739547
  • GENBANK/JF739548
  • GENBANK/JF739549