[Contemporary GWAS studies of depression: the critical role of phenotyping]

Zh Nevrol Psikhiatr Im S S Korsakova. 2022;122(1):50-61. doi: 10.17116/jnevro202212201150.
[Article in Russian]

Abstract

The need to use large samples to identify the genetic risk loci of mental disorders has led us to the dilemma of phenotyping quality. Especially this problem relates to such common mental disorders as depression (lifetime prevalence 16.2%). On the one hand, there is a very resource-intensive method of capturing patient data by physicians using diagnostic criteria of mental disorders (DSM-V/ICD-10). On the other, there is a popular method of minimal phenotyping using hospital registers, self-reports of respondents on symptoms, diagnosis and treatment of depression. To date, there is no ideal method for phenotyping depression because all of them focus only on its clinical symptoms. The active usage of minimal phenotyping in Genome-Wide Association Study (GWAS) has led to a significant increase in both clinical and genetic heterogeneity of depression. However, an important limitation of using DSM-V/ICD-10 is the high cost of phenotyping due to the involvement of medical specialists. Thus, the most rational is to use electronic diagnostic questionnaires based on DSM-V/ICD-10 criteria. Such an approach will accelerate the increase in research capacity, but will preserve all internal contradictions inherent in official diagnostic classifications (heterogeneity of phenotypes, absence of objective diagnostic criteria, categorical approach, etc.). In this regard, the critical role of psychiatric epidemiology is growing both in the development of standardized tools for operationalized diagnostic criteria and in future GWAS by introducing new phenotypic subtypes of depression and its dimensions.

Необходимость использования больших выборок для идентификации локусов генетического риска психических расстройств привела нас к дилемме качества фенотипирования. Особенно эта дилемма касается таких распространенных в популяции психических расстройств, как депрессия (распространенность в течение жизни до 16,2%). С одной стороны, имеется очень ресурсозатратный метод сбора данных о пациентах врачами с использованием диагностических критериев классификаций психических расстройств (DSM-5/МКБ-10). С другой стороны, применяется популярный метод минимального фенотипирования с использованием больничных регистров, самоотчетов респондентов о симптомах, диагнозах и лечении депрессии. На сегодняшний день не существует идеального метода фенотипирования данного расстройства вследствие объяснимой концентрации любого метода диагностики только на его клинических симптомах. Активное использование минимального фенотипирования в исследованиях по полногеномному поиску ассоциаций (от англ. Genome-wide association study, GWAS) привело к значительному увеличению как клинической, так и генетической гетерогенности депрессии. С другой стороны, важным ограничением использования DSM-5/МКБ-10 является высокая стоимость такого фенотипирования за счет привлечения врачей-специалистов. Таким образом, наиболее рациональным представляется использование электронных диагностических опросников, основанных на критериях DSM-5/МКБ-10. Такой подход позволит ускорить увеличение мощности исследований, но сохранит все внутренние противоречия, свойственные официальным диагностическим классификациям (гетерогенность фенотипов, отсутствие объективных критериев диагностики, категориальный подход и др.). В связи с этим растет критическая роль психиатрической эпидемиологии как в разработке стандартизированных инструментов для операционализированных диагностических критериев, так и в проведении будущих исследований типа GWAS путем внедрения новых фенотипических подтипов депрессии и ее дименсий.

Keywords: GWAS; SNP; depression; endophenotype; phenomics; psychiatric genetics.

MeSH terms

  • Depression / diagnosis
  • Depression / epidemiology
  • Depression / genetics
  • Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders
  • Genome-Wide Association Study*
  • Humans
  • International Classification of Diseases
  • Mental Disorders* / therapy